锚头鳋可用生石灰清塘消毒杀灭幼虫，或用高锰酸钾溶液浸洗鱼体杀死幼虫和部分成虫。此外，用蛛虫必杀（蜂房芽孢杆菌B-91）泼洒也有一定效果。这些方法相对环保，对鱼的伤害较小，且不易污染水质。
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到了秋天，一些主养草鱼或者花白鲢的池塘，如果水质不怎么好，比较瘦的话，池塘的鱼很容易就会长锚头蚤，像现在这个水温范围，特别适合锚头蚤的生长。
叮咬鱼的锚头蚤都是雌虫，锚头蚤的分类地位是甲壳类动物，和龙虾，螃蟹亲缘关系更近一些，一些寄生在鱼体表面的锚头蚤，首先是头部钻入宿主肌肉中，造成组织的损伤、发炎，形成溃疡。病鱼通常呈烦躁不安、食欲减退、行动迟缓、鱼体消瘦等常规病态。锚头蚤头部插入鱼体肌肉、鳞下，身体大部露在鱼体外部且肉眼可见，就好比在鱼体上插入小针，尤其是对鱼种阶段，危害特别大。将患锚头蚤病的鱼取出放在解剖盘里，仔细检查病鱼的体表、鳃、口腔和鳞片等处，若看到一根根似针状的虫体即是锚头蚤的成虫。
尤其是卖完鱼出准备放新苗的需要注意防范。可以参考下面的预防方法：
1、鱼种放养前使用生石灰等清塘产品彻底清塘，生石灰带水清塘效果最好，杀死池塘中的锚头鳋的幼体。
2、鱼种放养的过程中，可以使用聚维酮碘药浴一下，按照1方水50g的用量，可以杀灭附着在鱼种体表的幼虫。
3、生物控制法：平时注意保持水体肥度，水肥一点里面其他浮游动物会比较多，部分可以吃掉锚头蚤幼体，另外每亩水面放50—100克的黄颡鱼20-50尾，利用黄颡鱼对锚头鳋幼虫的摄食，起到预防锚头鳋的作用。
在养殖过程中主要用到防治锚头蚤病的药物是敌百虫和菊酯类(包括高效氯氰菊酯和氰戊菊酯)，但在杀虫的过程中千万要注意用药的安全，以及名特品种(如鲈鱼，鳜鱼，淡水白鲳，海水鱼，虾蟹等)以及苗种对药物的敏感性，需要特别注意，以免产生药害事故。
杀虫药的用药安全问题也是养殖户比较担心的问题，既想要解决寄生虫问题，又不想杀虫药危害鱼体，那么应该怎么办呢？这就需要我们转变一下思路，做到“以驱代杀，以防代治”。